旧別当神宮寺の「古記」によると、永延年間（８世紀末）、当地に大蛇が出没して人畜、作物に害を与え住民を困らせていた。 そこで熊野参詣の神道者の勧めにより、出雲の素盞嗚命の分霊を勧請したところ大蛇は退散したと言う。

中世以降は、武塔天神宮と称し、境内に神宮寺があった。天満天神・武塔天神（素盞鳴命）蔵王権現の3座を祀り、山田庄9箇村の総社として、地頭、庄司などから田地が寄進された。明治3年神仏分離して須佐神社と改称、以後神官が奉仕することになった。明治41年氏下中の18社を合祀、現在に至る。

3月10日には、古来から伝わる奉幣神事である「おとう祭り」が斎行され、10月の第2日曜日には、秋の例大祭である「森祭り」が行われる。